Mochales perteneció, desde los primeros momentos de la repoblación  al Señorío de Molina, puesto que figura incluido en el territorio que se delimita como propio en el Fuero que D. Manrique de Lara da a esta zona.

Esta dependencia política, al igual que ocurre con Algar y Villel, no se corresponde con la eclesiástica, toda vez que pertenecerá la Arciprestazgo de Medinaceli, en lugar de al de Molina, hasta el siglo XIX.

En 1.258 el infante D. Alfonso, cuarto señor de Molina, hace donación, en usufructo, de Mochales a su suegra Doña Sancha Gómez, aunque sigue, especialmente su castillo, bajo el control de los señores de Molina, y de la corona de Castilla.

Estas vicisitudes las recoge Francisco Núñez en su obrfa "Archivo de las cosas notables de esta leal villa de Molina" escrito en el siglo XVI, cuando, citando a su vez a Zurita, dice que: " Zurita lib. 10 Cap. 14 dize que quando el Rey Dn Enrique de Castilla entro en el Reyno matando a su hermano el Rey Dn Pedro, el Castillo de Messa estaba por el Rey Dn Pedro de Aragon y embio este Rey alli a Dn Jayme Cañamero con gente de guarnizion pero de alli a poco tiempo estaba ya por el Rey de Castilla y no dize como lo hubo bajo su poder. Al prinzipio que rompio la guerra el Rey Dn Pedro de Castilla contra el Rey Dn Pedro de Aragon Mochales y Villel eran del Rey de Aragon y por tener poca defensa les mando el Rey de aragon los desamparasen y se fuesen los vezinos a Calatayud, a poco después ya eran de Castilla porque dize Zurita lib. 9 Cap. 8 que el Conde de Trastamara y Dn Juan Tello y los Condes de Luna entregaron los Castillos de Messa y Villel a la orden del Rey de Castilla año de 1359 aunque siempre tubieron diferenzias los Reyes de Castilla y Aragon sobre a qual de los Reynos pertenezina Ville y Algar como refiere Zurita "

A la muerte del rey Sancho IV, y aprovechando la anarquía que se produjo en Castilla, Mochales, junto con los demás pueblos del valle del Mesa pasaron, por la fuerza, a poder de la familia de los Funes.

Bajo el señorío de esta familia, Algar, Mochales y Villel se segregaron del Señorío de Molina y pasaron a depender de la Corona de Aragón, a finales del siglo XIII, si bien en el siglo siguiente volverían a formar parte de Castilla y concretamente del Señorío molinés.

Toribio Minguella recoge en su "Historia de la Diócesis de Sigüenza y sus Obispos" el censo que se realiza en 1353 de todas las parroquias de la Diócesis, y en el que figura Mochales como feligresía única, dependiente del Arciprestazgo de Medinaceli, servida por tres beneficios con una renta anual de 400 maravedís: "enla eglesia de mochales son tres beneficios el curado ha la quinta parte e riende cient mrs. los dos beneficios de los absentes rienden cada uno 150 mrs."

En el siglo XV Don Iñigo López de Mendoza es nombrado alcaide del castillo de Molina, y entre las donaciones que recibe del rey castellano figura Mochales, de donde consta como señor de la villa y castillo en 1.476.

Permaneció en poder de los Mendoza de Molina, más tarde condes de Priego y marqueses de Mochales, al menos hasta el siglo XVII. Posteriormente pasó a los marqueses de Pabón hasta el siglo XIX (en 1.804 figura de su propiedad).

Gregorio López la Torre Malo en su "Chorográfica descripción del muy noble, leal, fidelíssimo y valerosíssimo Señorío de Molina" escrito en el siglo XVIII dice: " Mochales, villa a orillas del rio Mefa con fu caftillo, en un valle ameno. Mandola el Infante Don Alonfo de Molina a fu suegra Doña Sancha Gómez el año de 1258 por los dias de fu vida. El año de 1476 era señor de ella Iñigo López de Mendoza ".

Dentro de su término se encuentran los despoblados medievales de “Bronchales” o “Los Casares”, a unos 3.800 m al noroeste del pueblo (a unos 900 m. de Iruecha en el Ducado de Medinaceli) donde debió de existir una torre vigía en torno a una tenada actual, y el de “Euladigo” o "Villaorcas" a 2.900 m. al suroeste, en la ribera derecha del río Mesa y lindando con él, donde también se recuerda la existencia de otra torre.

Tuvo dos molinos harineros a orillas del Mesa, así como hasta veinte telares de lienzo y se explotaron canteras de yeso blanco y negro y de jaspe de todos los colores.

ANTONIO ALBA

Alcalde de Mochales durante la Guerra de la Independencia, fue ahorcado en la plaza del pueblo por los franceses, en 1.810, acusado de suministrar alimentos a las tropas españolas de la Junta de Defensa de Molina.

Durante el período en que fue alcalde Antonio Alba, el pueblo fue saqueado cuatro veces por las tropas francesas, al parecer por conocer la colaboración de aquél con el General Castaños que se encontraba en la localidad de Sisamón, situado en Zaragoza a poca distancia de Mochales.

Según la tradición oral, en una de estas incursiones, una mujer evitó que se masacrase al pueblo entero, suplicando clemencia de rodillas al mando de la tropa francesa, quien conmutó el castigo colectivo por un nuevo saqueo.

La plaza del pueblo lleva el nombre de Antonio Alba, en recuerdo de su heroico comportamiento.

BEATA TERESA DEL NIÑO JESÚS

Eusebia García García nació en Mochales el 5 de marzo de 1.909, ingresando en las Carmelitas, donde tomó el nombre de Teresa del Niño Jesús y de San Juan de la Cruz

Fue asesinada en Guadalajara por las brigadas de milicianos la tarde el 24 de julio de 1.936 junto con otras dos compañeras: Pilar de San Francisco de Borja y María de los Ángeles de San José.

Las tres carmelitas fueron beatificadas el 29 de marzo de 1987, en la basílica de San Pedro de Roma por el Papa Juan Pablo II.

DIAZ TORREBLANCA “TARARI”

Aunque no fue natural de este pueblo, ni tampoco destacó en nada especial durante su vida, si que es interesante incluirlo en esta sección dado su peculiaridad.

Ejerció como medico de Mochales y más tarde de Argecilla (la Alcarria), donde falleció en 1.979.

Marino en su juventud, paso luego a ejercer de médico en un hospital alemán durante la Segunda Guerra Mundial.  Fue precisamente cuando concluyó esta contienda cuando, por razones que se desconocen, buscó refugio en pueblos recónditos de Guadalajara, entre ellos Mochales.

Vivía en el cerro de San Gabriel, en una casa debajo de las peñas, donde se decía que tenía una serpiente de gran tamaño como guardiana de la vivienda. Igualmente se comentaba que había excavado un túnel subterráneo para, en caso de urgencia, salir huyendo. La verdad es que ambas cuestiones son producto de la tradición oral, y nadie llego a comprobarlas.

Parece ser que el sobrenombre de “Tararí” le fue puesto porque cuando tenía que bajar al pueblo para atender a algún enfermo, el alguacil se comunicaba con él con señales de trompeta.

A pesar de las leyendas y rarezas que le rodearon el recuerdo que dejó en el pueblo fue de médico competente y persona de un gran calor humano.